Gastroenteroloji alanındaki güncel gelişmeleri temel alarak, bu alandaki eğitimin sürekli ve sistematik biçimde geliştirilmesiyle en yüksek düzeyde çağdaş eğitim standartlarını sağlamak ve sürdürülebilir kılmaktır.

Gastroenteroloji yan dal uzmanlık eğitimi alan öğrencilere, gastrointestinal hastalıkların tanı ve tedavi süreçlerini etkin bir şekilde yönetebilecekleri nitelikli bir eğitim programı sunmak; aynı zamanda bu öğrencilerin meslek yaşamları boyunca etik değerler doğrultusunda, bilimsel ve toplumsal sorumluluk bilinciyle çalışmalarını sürdürebilmelerine olanak tanımaktır.